Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R2

PTPN22, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 22, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN22Q9Y2R2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN22Q9Y2R2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN22Q9Y2R2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN22Q9Y2R2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN22Q9Y2R2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN22Q9Y2R2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN22Q9Y2R2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms