Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF13BQ9Y275 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFSF13BQ9Y275 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFSF13BQ9Y275 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF13BQ9Y275 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms