Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POMPQ9Y244 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POMPQ9Y244 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms