Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERVW-1Q9UQF0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERVW-1Q9UQF0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVW-1Q9UQF0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVW-1Q9UQF0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms