Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIAA1024Q9UPX6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KIAA1024Q9UPX6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIAA1024Q9UPX6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms