Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
AGTPBP1Q9UPW5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AGTPBP1Q9UPW5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGTPBP1Q9UPW5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms