Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGAP1Q9UPQ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGAP1Q9UPQ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGAP1Q9UPQ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms