Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX7Q9UNH6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX7Q9UNH6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms