Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
CDH7Q9ULB5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH7Q9ULB5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms