Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NRXN1Q9ULB1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NRXN1Q9ULB1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
NRXN1Q9ULB1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.81■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms