Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HCN2Q9UL51 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCN2Q9UL51 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HCN2Q9UL51 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HCN2Q9UL51 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN2Q9UL51 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN2Q9UL51 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN2Q9UL51 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN2Q9UL51 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN2Q9UL51 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN2Q9UL51 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN2Q9UL51 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN2Q9UL51 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HCN2Q9UL51 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms