Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MID2Q9UJV3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MID2Q9UJV3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MID2Q9UJV3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms