Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBE1Q9UJT0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TUBE1Q9UJT0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms