Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPA4Q9UI42 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CPA4Q9UI42 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPA4Q9UI42 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms