Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCN11AQ9UI33 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SCN11AQ9UI33 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SCN11AQ9UI33 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms