Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
OPN4Q9UHM6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPN4Q9UHM6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPN4Q9UHM6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms