Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms