Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA6Q9UF33 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA6Q9UF33 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA6Q9UF33 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms