Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF12

PRODH2, Hydroxyproline dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODH2Q9UF12 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRODH2Q9UF12 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRODH2Q9UF12 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRODH2Q9UF12 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRODH2Q9UF12 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRODH2Q9UF12 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRODH2Q9UF12 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRODH2Q9UF12 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRODH2Q9UF12 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms