Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
CFDP1Q9UEE9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms