Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLN8Q9UBY8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLN8Q9UBY8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms