Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXTL2Q9UBQ6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXTL2Q9UBQ6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms