Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCL2Q9UBD3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
XCL2Q9UBD3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XCL2Q9UBD3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms