Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC17A7Q9P2U7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC17A7Q9P2U7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SLC17A7Q9P2U7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A7Q9P2U7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A7Q9P2U7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A7Q9P2U7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A7Q9P2U7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A7Q9P2U7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A7Q9P2U7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A7Q9P2U7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A7Q9P2U7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC17A7Q9P2U7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A7Q9P2U7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A7Q9P2U7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A7Q9P2U7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A7Q9P2U7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A7Q9P2U7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC17A7Q9P2U7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC17A7Q9P2U7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms