Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
RRBP1Q9P2E9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RRBP1Q9P2E9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RRBP1Q9P2E9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms