Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
GCNT4Q9P109 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GCNT4Q9P109 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCNT4Q9P109 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms