Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCMF1Q9P0J7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCMF1Q9P0J7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms