Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCKIPSDQ9NZQ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCKIPSDQ9NZQ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCKIPSDQ9NZQ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 836.9 ms