Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ARHGEF12Q9NZN5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
ARHGEF12Q9NZN5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ARHGEF12Q9NZN5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms