Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GGA3Q9NZ52 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GGA3Q9NZ52 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GGA3Q9NZ52 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms