Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRN3Q9NYV6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRN3Q9NYV6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRN3Q9NYV6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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