Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLCO1C1Q9NYB5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLCO1C1Q9NYB5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms