Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM260Q9NX78 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM260Q9NX78 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM260Q9NX78 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms