Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN6Q9NWW5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN6Q9NWW5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms