Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.54■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
POLR3EQ9NVU0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLR3EQ9NVU0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms