Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TCP11L1Q9NUJ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms