Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CISHQ9NSE2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CISHQ9NSE2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms