Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
TULP4Q9NRJ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TULP4Q9NRJ4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TULP4Q9NRJ4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TULP4Q9NRJ4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms