Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM7Q9NQW5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM7Q9NQW5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms