Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRTAC1Q9NQ79 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRTAC1Q9NQ79 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRTAC1Q9NQ79 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms