Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA4BQ9NPR2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA4BQ9NPR2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA4BQ9NPR2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms