Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED4Q9NPJ6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED4Q9NPJ6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MED4Q9NPJ6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED4Q9NPJ6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED4Q9NPJ6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED4Q9NPJ6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED4Q9NPJ6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED4Q9NPJ6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED4Q9NPJ6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED4Q9NPJ6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms