Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ1

MKKS, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKKSQ9NPJ1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKKSQ9NPJ1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKKSQ9NPJ1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKKSQ9NPJ1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKKSQ9NPJ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKKSQ9NPJ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKKSQ9NPJ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKKSQ9NPJ1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MKKSQ9NPJ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKKSQ9NPJ1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms