Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCB9Q9NP78 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms