Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSU72Q9NP77 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSU72Q9NP77 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms