Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMG20AQ9NP66 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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