Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CBX8Q9HC52 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBX8Q9HC52 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms