Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC4Q9HBW1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC4Q9HBW1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms