Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK4Q9HAZ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms