Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UPF2Q9HAU5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms